【2025】電子カルテのシェアランキング｜おすすめメーカー製品を徹底比較

本記事では、電子カルテのシェアランキングや人気の理由を紹介していきます。

また、各社ランキングで上位の電子カルテや各製品の特徴紹介などさまざまな観点から解説しているのでぜひ参考にしてみてください。

当コンテンツについて

当コンテンツは「セカンドラボ株式会社」が作成しております。 本記事のおすすめ電子カルテは、電子カルテを選ぶうえでの重要項目である機能の豊富さ、使いやすさ、価格、シェア・導入実績、サポート体制を総合的に評価したうえで決定しています。

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この記事は2025年9月時点の情報に基づいて編集しています。

目次

• 【2025最新】電子カルテのシェアランキング表
• シェアランキングの高い電子カルテ16選
• シェア率以外の電子カルテの選び方・ポイント
• 電子カルテの比較一覧表
• 施設規模・診療科別の電子カルテシェアランキング
• 電子カルテのメリット・デメリット
• 電子カルテの普及率はどのくらい？
• 【各社の調査結果】電子カルテのシェアランキング
• エムスリーデジカルがシェア拡大｜シェア争いをどこが制するか
• 電子カルテのQ＆A
• まとめ

【2025最新】電子カルテのシェアランキング表

電子カルテのシェア情報を毎年発表している媒体は「ｍ3.com」「ITトレンド」「日経メディカル」の3つがあります。このうち、医師の9割以上が登録している「ｍ3.com」が公表しているランキングを紹介します。「ITトレンド」「日経メディカル」が公表しているランキングもこの記事の後半で紹介しています。

＞＞＞「ITトレンド」「日経メディカル」が公表しているランキングはこちらで紹介しています

出典：【2025年版】クリニック向け電子カルテ購入シェアランキング

【2023】クリニック向け電子カルテのシェアランキング

続いて2年前のクリニック向け電子カルテのシェアランキングも見てみましょう。こちらも「ｍ3.com」が公表しているランキングを紹介します。2025年のランキングとのシェアランキングの変動を見てみましょう。

出典：【2023年版】クリニック向け電子カルテ購入シェアランキング

2年間でのランキングの変動

2025年と2023年のランキングを比較すると、次のようなことが読み取れます。

• 1位M3デジカル、2位ウィーメックスは2年間から変わらない
• ランキングのラインナップも大きく変わらない
• HOPE（富士通）、CLIUS(DONUTS)がシェアを伸ばしている

シェアランキングの高い電子カルテ16選

ここでは、電子カルテのシェアランキングでも人気の高い製品を16選を紹介します。シェアランキングが高いことは電子カルテを選ぶ際の判断材料の1つになるはずです。それぞれの特徴も記載しているので参考にしてみてください。

シェア率以外の電子カルテの選び方・ポイント

シェア率が高いだけで電子カルテを決めて良いのだろうか、とお考えの方もいらっしゃると思います。ここではエムスリーが「電子カルテ購入の決め手」のテーマでアンケートをとった結果の上位4項目から、電子カルテを選ぶ際のポイントを解説します。電子カルテを決めるにあたって慎重になるのは当然なので、以下のポイントでも検討してみてください。

1. 価格
2. レセコン一体型かどうか
3. クラウド型かどうか
4. 操作性はどうか
5. 利用したい外部サービスと連携できるか
6. サポート体制の充実度

電子カルテの選び方については【2024最新】電子カルテ徹底比較｜選び方やおすすめメーカーまででも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

価格

導入の決め手として最も大きな要素は価格でした。電子カルテ導入にかかる初期費用の相場は、クラウド型で100万～200万円、オンプレミス型で250万～400万円程度です。特に開業時は様々な初期費用がかかるため、費用を抑えられる製品を選ぶ先生が多いようです。

初期費用を抑えられる電子カルテを選ぶなら、エムスリーデジカルがおすすめです。多くの電子カルテメーカーでは、メーカー指定のハード（PC等）代金が含まれているため高額になりがちですが、クラウド型のデジカルではお使いのハードで電子カルテを運用することができます。5年間（60か月）使い続けた場合でも、1,180,000円（19,800円×60ヵ月）なので、コストを抑えることができます。

エムスリーデジカルと比較されるケースの多いクラウド型電子カルテを5年間使い続けた場合のトータルコストを整理したので、参考にしてみてください。CLIUSも低コストで運用できることがわかりますが、導入時の端末セットアップ、初期セット作成は別料金なので、料金体系が明確である点からもエムスリーデジカルを選ぶ先生が多いです。

製品名	5年間のトータルコスト	初期費用	月額費用
エムスリーデジカル	1,188,000円	0円	19,800円
CLINICS	2,880,000円	480,000円	40,000円
CLIUS	920,000円～	200,000円~	12,000円
Medicom	4,418,000円	2,900,000円	25,300円

電子カルテの価格については電子カルテ導入費用の相場はいくら？運用コストを抑える方法もでも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

レセコン一体型かどうか

医師が診療の経過を記録する電子カルテと、診療報酬の請求業務につかうレセコンが一体となったレセコン一体型かどうかを重視する先生も多いようです。

レセコン一体型電子カルテでは、電子カルテとレセコンを同じ端末で操作できるため、業務の効率化が期待できます。具体的な商品（メーカー）としては、BrainBoxVIII（株式会社ユヤマ）、Medicom-HRf（ウィーメックス株式会社）、Dynamics（株式会社ダイナミクス）などが挙げられます。

レセコン一体型の電子カルテについてはレセコン一体型電子カルテとは？分離型との違いやおすすめ製品などでも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

クラウド型かどうか

院内にサーバーを設置することなく、インターネット上（クラウド）でデータを保管する「クラウド型」かどうかを重視する先生も近年増えています。院内にサーバーを設置する「オンプレミス型」がこれまでは主流でしたが、開業5年未満のクリニックでは初期費用を抑えられる点に魅力を感じ、クラウド型電子カルテ導入が着実に進んでいます。初期費用を抑えられるメリットに魅力を感じ、クラウド型を選択する先生はこれからも増えていくでしょう。

出典：クラウド型電子カルテの最新シェアと、従来のオンプレミス型とのコスト比較

操作性はどうか

電子カルテの操作性を評価するポイントは、以下のとおりです。それぞれについて、解説していきます。

• ・画面設計のわかりやすさ
• ・入力方法の多様性
• ・機能の使いやすさ
• ・カスタマイズ性の高さ

画面設計のわかりやすさ

電子カルテの画面設計がわかりにくいと、操作に手間がかかり、ミスを起こしやすくなります。画面設計は、直感的に操作できるように、シンプルでわかりやすいものを選びましょう。

入力方法の多様性

入力方法が単一だと、入力に手間がかかり、業務効率が低下します。キーボード入力に加えて、タッチ操作や音声入力などの入力方法が用意されているものを選びましょう。

機能の使いやすさ

電子カルテには、さまざまな機能が搭載されています。機能が使いにくいと、必要な情報を探すのに手間がかかり、業務効率が低下します。機能の使いやすさを事前に確認しておきましょう。

カスタマイズ性の高さ

電子カルテは、医療機関や医師のニーズに合わせてカスタマイズできるものが望ましいです。カスタマイズ性の高さを確認しておきましょう。

連携できる外部サービス

電子カルテは、診療情報の電子化によって業務効率化や患者サービスの向上を図るシステムです。近年では、電子カルテと外部サービスの連携が進んでおり、より便利で効率的な診療環境を実現できるようになってきています。

外部サービスと連携できる主なシステムは、以下の通りです。

• 予約管理システム
• 自動受付システム
• 保険証読み取りシステム
• 問診票システム
• 検体検査システム
• 画像管理システム
• レセプトコンピューターシステム
• 経営管理システム

これらのシステムと連携することで、以下のようなメリットが得られます。

• 業務の自動化・効率化
• 患者情報の一元管理
• 患者サービスの向上

電子カルテと外部サービスが連携することで、業務効率化や患者サービスの向上が期待できます。そのため、電子カルテを選ぶ際には、外部サービスとの連携状況を必ず確認するようにしましょう。

電子カルテと連携できるサービスについては電子カルテ連携とは？連携できるシステムの種類やメリットを解説でも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

サポート体制の充実度

システムに不具合があった場合、スムーズなサポートを受けられるかどうかも関心が高いです。電子カルテが止まってしまうと、最悪の場合診療が止まってしまう事態になるので、各メーカーの担当者にしっかり確認する必要があります。

各社のサポート体制を比較すると、歴史のあるメーカーに軍配があがります。ウィーメックスやユヤマ、富士通などは拠点の営業所から担当者が駆けつける体制を構築している一方、クラウド型のメーカーは基本的に電話やメール、チャットでの対応になります。クラウド型は人的コストを削減しているから低価格を実現できている側面もあり、サポート体制と価格のどちらを優先するかを決める必要があると言えそうです。

電子カルテのサポート体制については電子カルテのサポート体制は確認必須！比較したいポイント等を解説でも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

電子カルテの比較一覧表

対象施設（クリニック、病院）、クラウド型かオンプレミス型かによって主要な製品を分類した図を作成しました。この記事に掲載されていない製品も一部含まれていますが、参考にしていただければ幸いです。

おすすめ電子カルテを一覧表にまとめました。いずれも電子カルテを選ぶ際に基本となるデータです。詳細は、以下の表を横にスクロールして確認することができます。

施設規模・診療科別の電子カルテシェアランキング

ここまでのランキングでは、一般診療所や病院で使われている一般クリニック向け電子カルテを比較してきました。ここからは、施設規模・診療科別の電子カルテシェアランキングを紹介していきます。なお、詳細にシェアを調査している情報がなかった項目については、セカンドラボが調査した結果シェアが高いと思われるメーカーを掲載しています。

• ・病院向け電子カルテのシェアランキング
• ・精神科向け電子カルテのシェアランキング
• ・産婦人科向け電子カルテのシェアランキング
• ・眼科向け電子カルテのシェアランキング

病院向け電子カルテのシェアランキング

病院向け電子カルテのシェアランキングは、電子カルテメーカーであるソフトウェア・サービスが「月間新医療　医用機器システム白書2023」からまとめた情報がありました。クリニックと病院とでは、導入されている電子カルテメーカーが大きく異なることが分かります。

病院向け電子カルテ ベンダー別稼働状況(2021年度)

メーカー名	代表製品名	合計件数	シェア
富士通Japan	HOPEシリーズ	1,099	33%
ソフトウェア・サービス	新版e-カルテ	740	22%
シーエスアイ	MI・RA・Is/AZ（ミライズ/エーズィー）	431	13%
NEC	MegaOakシリーズ	227	7%
ソフトマックス	PlusUs-カルテ	132	4%
ワイズマン	電子カルテシステムER	125	4%
レスコ	精神科病院向け「Alpha」	100	3%
JBCC	blanc、プシュケ	90	3%
富士フイルムヘルスケアシステムズ	Hi-SEED シリーズ	66	2%
日本ＩＢＭ	IBM CIS+	50	2%
ＳＢＳ情報システム	統合型電子カルテシステム「PrimeKarte」	38	1%
その他	-	208	6%

出典：電子カルテのシェア情報
※合計件数、シェアは稼働実績ベースでの計測

精神科向け電子カルテのシェアランキング

精神科向け電子カルテのシェアランキングを調査したデータは公開されていません。セカンドラボでメーカー各社のHPを調査した結果、こちらの3社が精神科で導入実績が豊富でした。参考にしてみてください。

精神科向け電子カルテについては精神科電子カルテおすすめ比較19選｜精神科に電カルは必要？でも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

産婦人科向け電子カルテのシェアランキング

産婦人科向け電子カルテのシェアランキングを調査したデータは公開されていませんでした。セカンドラボでメーカー各社のHPを調査した結果、こちらの4社が精神科で導入実績が豊富でした。参考にしてみてください。

産婦人科向け電子カルテについては【徹底比較】産婦人科向け電子カルテおすすめ10選｜選び方まででも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

眼科向け電子カルテのシェアランキング

眼科向け電子カルテのシェアランキングを調査したデータは公開されていません。セカンドラボでメーカー各社のHPを調査した結果、こちらの3社が眼科で導入実績が豊富でした。参考にしてみてください。

眼科向け電子カルテについては【徹底比較】眼科におすすめの電子カルテメーカー9選｜価格や選び方まででも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

電子カルテのメリット・デメリット

電子カルテは紙カルテに比べて、業務効率化や情報共有などのメリットがある一方で、コストやセキュリティなどのデメリットもあります。

電子カルテのメリット

電子カルテの代表的なメリットは、以下の通りです。

• ・業務効率化
• ・スムーズな情報共有
• ・診療の質の向上

業務効率化

紙カルテでは、患者の情報を記入したり、情報を探したりするのに時間がかかります。電子カルテでは、キーボードやマウスで簡単に情報を入力・検索できるため、業務効率が向上します。

スムーズな情報共有

電子カルテでは、複数の医療機関や医師間で情報を共有することができます。これにより、患者の状態をより正確に把握し、適切な診療を行うことができます。

診療の質の向上

電子カルテでは、過去の診療履歴や検査結果を簡単に確認することができます。これにより、医師は患者の状態をより深く理解し、適切な診療を行うことができます。

電子カルテのデメリット

電子カルテの代表的なメリットは、以下の通りです。

• ・導入コスト
• ・セキュリティ面のリスク
• ・運用に時間と手間がかかる

導入コスト

電子カルテの導入には、初期費用やランニングコストがかかります。初期費用は、導入するシステムの種類や規模によって異なりますが、数百万円から数千万円程度かかります。ランニングコストは、システムの利用料や保守・メンテナンス費用などです。

セキュリティ面のリスク

電子カルテには、患者の個人情報が大量に含まれています。そのため、サイバー攻撃による情報漏洩のリスクがあります。セキュリティ対策を十分に講じることが重要です。

電子カルテのセキュリティについては電子カルテの情報セキュリティを解説｜情報漏洩の原因や対策まででも詳しく解説しています。ぜひ参考にしてください。

運用に時間と手間がかかる

電子カルテを導入してすぐに使えるわけではありません。システムの導入や運用に、時間と手間がかかります。また、スタッフの教育も必要です。

電子カルテの普及率はどのくらい？

この記事では、たくさんの電子カルテのうち、複数の観点でシェアランキングを紹介してきますが、そもそも、医療機関全体の中で電子カルテがどの程度普及しているのでしょうか？国が発表しているデータを参考にしながら紹介していきます。

電子カルテの普及状況の推移

厚生労働省　電子カルテ等の普及状況の推移を基にセカンドラボ作成

厚生労働省が発表しているデータから、電子カルテの普及率をグラフにしてみました。令和2年時点での電子カルテの普及率は一般病院で57.2%、一般診療所49.9%となっています。 病院、診療所とも年々普及率が上昇していますが、200床未満の病院と一般診療所では、普及率が50%程度であることがわかります。

電子カルテがなかなか普及しない理由

紙カルテを使っていた期間が長く、今から高い費用をかけてまで電子カルテに移行しようというモチベーションがわかないことが大きな原因だと考えられます。電子カルテのメリットとして院内業務の効率化があげられることが多いですが、地方のクリニックなどでは、医師と看護師が紙カルテを受け渡しているやり方に慣れ切っているケースも多いです。

【各社の調査結果】電子カルテのシェアランキング

ここでは、「ｍ3.com」「ITトレンド」「日経メディカル」で公表している最新の電子カルテのシェアランキングをご紹介します。それぞれ異なる方法での計測になるので順位に違いはありますが、おおむね上位陣は同じような顔ぶれなので各社のシェア率の参考にしてみてください。計測方法やアンケート対象は下記の通りになります。なお、ITトレンドのランキングには一部病院向け電子カルテも含まれています。

ランキング順位	ｍ3.com	ITトレンド	日経メディカルOnline
1位	M3デジカル エムスリーデジカル	CLIUS CLIUS	Medicom-HRシリーズ ウィーメックス
2位	Medicom-HRシリーズ ウィーメックス	Medicom-HRシリーズ ウィーメックス	M3デジカル エムスリーデジカル
3位	HOPEシリーズ 富士通Japan	MAPs for CLINIC／MRNシリーズ EMシステムズ	Dynamics ダイナミクス
4位	BrainBoxシリーズ ユヤマ	CLINIICS メドレー	BrainBoxシリーズ QUALISシリーズ
5位	モバカルネット NTTプレシジョンメディシン	QUALISシリーズ ビー・エム・エル	－
6位	CLIUS Donuts	M3デジカル エムスリーデジカル	CLINIICS メドレー
7位	QUALISシリーズ ビー・エム・エル	Henry ヘンリー	CLIUS CLIUS
8位	CLINIICS メドレー	blanc JBCC	HOPEシリーズ TOSMECシリーズ
9位	Dynamics ダイナミクス	m-KARTE LSIメディエンス	－
10位	SUPER Clinicシリーズ NAVIS-CL MAPs for CLINIC／MRNシリーズ	Medicom-CKⅡ ウィーメックス	Hi-SEEDシリーズ Dopanet Doctors／Doctor`s Desktop3

今回3種類のランキングを見ると、Medicomシリーズ（ウィーメックス）やM3デジカル（エムスリーデジカル）の導入シェア率はどの計測方式でも順位が高く、シェア率の高さが感じ取れます。

出典：m3.com「【2025年版】クリニック向け電子カルテ購入シェアランキング」

出典： ITトレンド「ITトレンド年間ランキング2024 電子カルテ」

出典：日経メディカル「第24回　【医師774人に聞いた】電子カルテ導入シェアランキング2024速報！」

エムスリーデジカルがシェア拡大｜シェア争いをどこが制するか

各社が集計したランキングをセカンドラボで調査した結果、エムスリーデジカル、Medicomシリーズ(ウィーメックス)、Brain Boxシリーズ(ユヤマ)はすべての調査でランキング上位との結果でした。

クラウド型電子カルテの拡大が続き、各社とも自社電子カルテの導入件数を明らかにしていないメーカーが多い中、エムスリーデジカルは導入件数4500件という実績を公開しています（23年2月時点）。5000件の目標に向けて、急速にシェアを拡大しているだけでなく、初期費用を抑えられる点も魅力です。

Medicomシリーズは、実績のあるウィーメックス株式会社が提供しているだけあり、多くの医師が信頼して使っているのでしょう。Brain Boxシリーズは、AIによるデータ分析機能を搭載している点が人気を集めています。

参考：エムスリー株式会社　決算説明資料

電子カルテのQ＆A

電子カルテに関してよくある質問をQ＆A形式で解説します。あなたが気になる質問をチェックしてみてください。

↓クリック・タップで回答にジャンプします

Q.導入までの期間はどのくらい？

A.2～3か月程度が一般的です。 データ移行や他システムとの連携に時間がかかります。

Q.現在の電子カルテデータを移行できますか？

A.「患者の基本情報(名前、住所、年齢等の基本情報)」、「保険」、「病名」などを移行できるケースが多いです。

Q.クラウド型電子カルテはセキュリティ面に問題はない？

A.各社のセキュリティ対策は日々向上しており、安全性に問題はないといえるでしょう。最近は官公庁でもクラウドが利用されています。

Q.クラウド型電子カルテはどうして料金が安いの？

A.営業担当が直接医院に訪問せず、ウェブ会議や電話などのサポート対応にするなどして低コストを実現しています。 またクラウド型電子カルテを提供する企業のほとんどは、別の事業でも収益を得ており、電子カルテで利益をとらなくても一定期間はサービス提供を継続できます。

Q.インターネットが繋がらない場合はどうすれば良い？

A.インターネットに接続できない時は、電子カルテを利用できません。スマートフォンのデザリングなどで利用できるケースもあり、非常時用に準備しておくと良いでしょう。

まとめ

今回は、電子カルテシェアランキングをご紹介してきました。比較した中では、エムスリーデジカル、Medicomシリーズがシェアランキングでも上位に位置していました。

各医療機関でニーズや予算なども異なりますので、本記事を参考にして自院に合った電子カルテを選んでください。施設別のおすすめ電子カルテもご紹介していますので、下記のページも参考にしてもらえると幸いです。